Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 RTL5-202ENST00000609883 4105 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 AP1B1-202ENST00000357586 4176 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 FGF10-AS1-201ENST00000502457 1894 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 USP17L7-201ENST00000530447 2022 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 MTHFSD-204ENST00000546093 2451 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 ZNF774-201ENST00000354377 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 ATXN2L-205ENST00000395547 3981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 AL359845.1-201ENST00000458202 1648 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 AGAP6-202ENST00000412531 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 RAB37-203ENST00000392612 2528 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 CCER1-201ENST00000358859 2962 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 NLRP2-202ENST00000339757 3422 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 SCNN1B-202ENST00000343070 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 LDLRAD3-202ENST00000524419 1996 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 RAB3D-201ENST00000222120 4273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 DPY19L2P2-205ENST00000439473 3994 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 HERC3-203ENST00000407637 2634 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 TP53INP2-202ENST00000374810 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 HNF4A-204ENST00000415691 2302 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 ST5-256ENST00000534127 4545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 ARMCX2-202ENST00000330154 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 EPB42-210ENST00000622454 2227 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 FLT4-212ENST00000619105 3806 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 PRR3-202ENST00000376560 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 DDX12P-201ENST00000432996 2947 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 DNAJC14-202ENST00000317287 2774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 LINC01679-201ENST00000442815 2798 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 YTHDF3-201ENST00000517371 3122 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 KCNN1-201ENST00000222249 3625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 MAGED4-201ENST00000375626 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 WDR66-201ENST00000288912 4467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 ITGA2B-201ENST00000262407 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 POTEE-201ENST00000356920 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 BRAP-202ENST00000419234 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 PID1-204ENST00000409462 2387 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 USO1-201ENST00000264904 4135 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 ZCCHC18-206ENST00000611638 2941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 SLC25A17-217ENST00000544408 2060 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 ERAL1-201ENST00000254928 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 AC104758.3-203ENST00000562938 2123 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 AC019205.2-203ENST00000421315 3362 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 BANK1-202ENST00000428908 3044 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 TAPBP-234ENST00000434618 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CXCL3P19876 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
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