Protein–RNA interactions for Protein: P13569

CFTR, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, humanhuman

Predictions only

Length 1,480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFTRP13569 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CFTRP13569 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CFTRP13569 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CFTRP13569 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CFTRP13569 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CFTRP13569 Z95624.1-201ENST00000413528 628 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CFTRP13569 RIC3-205ENST00000425599 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CFTRP13569 CCND3P1-201ENST00000438347 580 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CFTRP13569 AC026310.2-201ENST00000546353 728 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CFTRP13569 SPAG5-AS1-204ENST00000556050 871 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CFTRP13569 TCL1A-209ENST00000557043 980 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CFTRP13569 KF455155.1-201ENST00000604493 303 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CFTRP13569 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CFTRP13569 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CFTRP13569 GLIPR1L2-201ENST00000320460 1729 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CFTRP13569 ART3-201ENST00000341029 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CFTRP13569 AL050341.2-201ENST00000567508 1541 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CFTRP13569 GPR45-201ENST00000258456 1307 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CFTRP13569 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CFTRP13569 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CFTRP13569 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CFTRP13569 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CFTRP13569 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CFTRP13569 C22orf42-201ENST00000382097 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CFTRP13569 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CFTRP13569 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CFTRP13569 GH1-203ENST00000351388 685 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CFTRP13569 LYPLA2-203ENST00000374503 868 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CFTRP13569 AL355482.2-201ENST00000428646 1145 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CFTRP13569 AC018845.3-201ENST00000562536 516 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CFTRP13569 ZFP1-207ENST00000567481 493 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CFTRP13569 AC004231.3-201ENST00000579136 258 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CFTRP13569 RN7SL524P-201ENST00000581152 300 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CFTRP13569 AC005786.2-201ENST00000592368 369 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CFTRP13569 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CFTRP13569 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CFTRP13569 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CFTRP13569 PTGR1-205ENST00000407693 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CFTRP13569 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CFTRP13569 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CFTRP13569 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CFTRP13569 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CFTRP13569 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CFTRP13569 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CFTRP13569 KRT18P44-201ENST00000416086 1285 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CFTRP13569 CBR3-AS1-202ENST00000427491 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CFTRP13569 TRAPPC4-202ENST00000434101 794 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CFTRP13569 AC006328.1-201ENST00000437571 379 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CFTRP13569 SRPK2P-201ENST00000523408 1100 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CFTRP13569 INO80E-209ENST00000567254 625 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CFTRP13569 CBR3-AS1-207ENST00000608641 777 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CFTRP13569 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CFTRP13569 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFTRP13569 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFTRP13569 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFTRP13569 MEFV-203ENST00000536379 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFTRP13569 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFTRP13569 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFTRP13569 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFTRP13569 LILRP2-202ENST00000413572 1383 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CFTRP13569 HNRNPC-205ENST00000553300 1375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFTRP13569 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFTRP13569 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFTRP13569 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFTRP13569 AL359649.1-202ENST00000375713 443 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFTRP13569 LINC01885-201ENST00000414300 609 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFTRP13569 AC010086.2-201ENST00000428616 226 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CFTRP13569 AC027612.2-201ENST00000436174 1145 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFTRP13569 PSME2P2-201ENST00000453033 700 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CFTRP13569 GRAMD4P6-201ENST00000556999 244 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CFTRP13569 LINC01836-201ENST00000586061 829 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFTRP13569 AC245595.2-201ENST00000620141 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFTRP13569 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFTRP13569 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFTRP13569 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFTRP13569 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFTRP13569 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFTRP13569 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFTRP13569 FAHD2B-201ENST00000272610 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFTRP13569 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFTRP13569 NEK3-210ENST00000620675 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFTRP13569 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFTRP13569 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFTRP13569 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFTRP13569 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFTRP13569 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFTRP13569 CCL25-202ENST00000315626 450 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFTRP13569 MAL-204ENST00000354078 831 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFTRP13569 SFMBT2-202ENST00000379711 692 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFTRP13569 AC079250.1-201ENST00000456046 531 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CFTRP13569 AC112250.1-201ENST00000504640 745 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CFTRP13569 RNA5SP420-201ENST00000516997 137 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CFTRP13569 ZNF724-202ENST00000597037 780 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFTRP13569 AC008982.2-201ENST00000600473 493 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFTRP13569 AL353622.2-201ENST00000605846 425 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CFTRP13569 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFTRP13569 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFTRP13569 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFTRP13569 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFTRP13569 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms