Protein–RNA interactions for Protein: P02679

FGG, Fibrinogen gamma chain, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGGP02679 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FGGP02679 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FGGP02679 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FGGP02679 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FGGP02679 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FGGP02679 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FGGP02679 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FGGP02679 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FGGP02679 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FGGP02679 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FGGP02679 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FGGP02679 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FGGP02679 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FGGP02679 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
FGGP02679 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FGGP02679 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
FGGP02679 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FGGP02679 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FGGP02679 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FGGP02679 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FGGP02679 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FGGP02679 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FGGP02679 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FGGP02679 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FGGP02679 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FGGP02679 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FGGP02679 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FGGP02679 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FGGP02679 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FGGP02679 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FGGP02679 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FGGP02679 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FGGP02679 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FGGP02679 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FGGP02679 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FGGP02679 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FGGP02679 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FGGP02679 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FGGP02679 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FGGP02679 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FGGP02679 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FGGP02679 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FGGP02679 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FGGP02679 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FGGP02679 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FGGP02679 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FGGP02679 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FGGP02679 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FGGP02679 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FGGP02679 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FGGP02679 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FGGP02679 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FGGP02679 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FGGP02679 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FGGP02679 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FGGP02679 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FGGP02679 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FGGP02679 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FGGP02679 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FGGP02679 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FGGP02679 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FGGP02679 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FGGP02679 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FGGP02679 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FGGP02679 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FGGP02679 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FGGP02679 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FGGP02679 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FGGP02679 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FGGP02679 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FGGP02679 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FGGP02679 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FGGP02679 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FGGP02679 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FGGP02679 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FGGP02679 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FGGP02679 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FGGP02679 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FGGP02679 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FGGP02679 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FGGP02679 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FGGP02679 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FGGP02679 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FGGP02679 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FGGP02679 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FGGP02679 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FGGP02679 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FGGP02679 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FGGP02679 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FGGP02679 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FGGP02679 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FGGP02679 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FGGP02679 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FGGP02679 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FGGP02679 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FGGP02679 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FGGP02679 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FGGP02679 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FGGP02679 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FGGP02679 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms