Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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ZBED1O96006 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
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ZBED1O96006 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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ZBED1O96006 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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ZBED1O96006 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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