Protein–RNA interactions for Protein: O95197

RTN3, Reticulon-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN3O95197 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTN3O95197 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTN3O95197 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTN3O95197 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTN3O95197 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTN3O95197 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RTN3O95197 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTN3O95197 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RTN3O95197 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RTN3O95197 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTN3O95197 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTN3O95197 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTN3O95197 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTN3O95197 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RTN3O95197 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTN3O95197 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTN3O95197 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTN3O95197 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTN3O95197 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTN3O95197 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTN3O95197 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTN3O95197 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTN3O95197 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RTN3O95197 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RTN3O95197 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTN3O95197 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTN3O95197 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTN3O95197 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTN3O95197 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTN3O95197 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTN3O95197 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
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RTN3O95197 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTN3O95197 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTN3O95197 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTN3O95197 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTN3O95197 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTN3O95197 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTN3O95197 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTN3O95197 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTN3O95197 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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RTN3O95197 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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RTN3O95197 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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RTN3O95197 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTN3O95197 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTN3O95197 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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RTN3O95197 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTN3O95197 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTN3O95197 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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RTN3O95197 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RTN3O95197 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RTN3O95197 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RTN3O95197 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RTN3O95197 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RTN3O95197 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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RTN3O95197 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RTN3O95197 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RTN3O95197 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RTN3O95197 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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RTN3O95197 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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RTN3O95197 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RTN3O95197 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RTN3O95197 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RTN3O95197 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RTN3O95197 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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RTN3O95197 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RTN3O95197 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RTN3O95197 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RTN3O95197 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RTN3O95197 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RTN3O95197 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RTN3O95197 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RTN3O95197 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RTN3O95197 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RTN3O95197 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RTN3O95197 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RTN3O95197 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RTN3O95197 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RTN3O95197 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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