Protein–RNA interactions for Protein: O60732

MAGEC1, Melanoma-associated antigen C1, humanhuman

Predictions only

Length 1,142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGEC1O60732 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MAGEC1O60732 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MAGEC1O60732 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
MAGEC1O60732 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MAGEC1O60732 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MAGEC1O60732 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
MAGEC1O60732 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
MAGEC1O60732 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
MAGEC1O60732 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
MAGEC1O60732 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MAGEC1O60732 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MAGEC1O60732 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
MAGEC1O60732 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MAGEC1O60732 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MAGEC1O60732 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MAGEC1O60732 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MAGEC1O60732 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MAGEC1O60732 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MAGEC1O60732 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MAGEC1O60732 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
MAGEC1O60732 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MAGEC1O60732 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MAGEC1O60732 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
MAGEC1O60732 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
MAGEC1O60732 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
MAGEC1O60732 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
MAGEC1O60732 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
MAGEC1O60732 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MAGEC1O60732 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC15.05■□□□□ -0
MAGEC1O60732 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.05■□□□□ -0
MAGEC1O60732 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
MAGEC1O60732 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MAGEC1O60732 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.05■□□□□ -0
MAGEC1O60732 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC15.05■□□□□ -0
MAGEC1O60732 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MAGEC1O60732 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MAGEC1O60732 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC15.05■□□□□ -0
MAGEC1O60732 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC15.05■□□□□ -0
MAGEC1O60732 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.05■□□□□ -0
MAGEC1O60732 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MAGEC1O60732 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MAGEC1O60732 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MAGEC1O60732 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
MAGEC1O60732 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MAGEC1O60732 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MAGEC1O60732 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MAGEC1O60732 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MAGEC1O60732 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MAGEC1O60732 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MAGEC1O60732 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MAGEC1O60732 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MAGEC1O60732 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MAGEC1O60732 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MAGEC1O60732 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MAGEC1O60732 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MAGEC1O60732 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MAGEC1O60732 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MAGEC1O60732 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MAGEC1O60732 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MAGEC1O60732 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MAGEC1O60732 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MAGEC1O60732 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MAGEC1O60732 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MAGEC1O60732 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MAGEC1O60732 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MAGEC1O60732 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MAGEC1O60732 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MAGEC1O60732 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MAGEC1O60732 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MAGEC1O60732 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MAGEC1O60732 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MAGEC1O60732 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MAGEC1O60732 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC15.04■□□□□ -0
MAGEC1O60732 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MAGEC1O60732 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
MAGEC1O60732 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
MAGEC1O60732 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MAGEC1O60732 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
MAGEC1O60732 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC15.04■□□□□ -0
MAGEC1O60732 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MAGEC1O60732 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC15.04■□□□□ -0
MAGEC1O60732 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.04■□□□□ -0
MAGEC1O60732 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MAGEC1O60732 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MAGEC1O60732 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
MAGEC1O60732 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MAGEC1O60732 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MAGEC1O60732 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MAGEC1O60732 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MAGEC1O60732 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MAGEC1O60732 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MAGEC1O60732 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MAGEC1O60732 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MAGEC1O60732 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MAGEC1O60732 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MAGEC1O60732 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MAGEC1O60732 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC15.04■□□□□ -0
MAGEC1O60732 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC15.04■□□□□ -0
MAGEC1O60732 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MAGEC1O60732 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms