Protein–RNA interactions for Protein: O43909

EXTL3, Exostosin-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL3O43909 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms