Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVV-1B6SEH8 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms