Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 MAPKAPK5-206ENST00000550735 11349 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 TTK-201ENST00000230510 3477 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 RGS3-205ENST00000374134 2862 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 PRR29-202ENST00000412177 3127 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 AC127496.1-201ENST00000576234 3133 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 KIFC3-211ENST00000562903 3221 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 TEX35-204ENST00000367642 2452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 GRIN1-202ENST00000371546 4114 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 SECISBP2-202ENST00000375807 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 GOLGA3-201ENST00000204726 9252 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 GTF2IRD2B-203ENST00000472837 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 INSC-207ENST00000528567 2237 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 ELN-222ENST00000458204 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 BCL2-201ENST00000333681 3209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 FXYD6-202ENST00000524656 1033 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 AC144450.1-201ENST00000366424 1641 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 GGA3-214ENST00000582717 2255 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 NFKB1-201ENST00000226574 4085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 RSBN1L-201ENST00000334955 6422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 HIPK3-202ENST00000379016 7345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 COL6A3-203ENST00000353578 9963 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 TBC1D8-AS1-201ENST00000610202 2478 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 C12orf43-202ENST00000445832 2397 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 GTF2IRD2-201ENST00000451013 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 TRPV1-206ENST00000571088 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 NADK-202ENST00000341991 3098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 AC004846.1-201ENST00000554614 3050 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 CICP1-201ENST00000416803 2410 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms