Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
HDGFL3Q9Y3E1 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.3
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
HDGFL3Q9Y3E1 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
HDGFL3Q9Y3E1 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
HDGFL3Q9Y3E1 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
HDGFL3Q9Y3E1 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
HDGFL3Q9Y3E1 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
HDGFL3Q9Y3E1 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HDGFL3Q9Y3E1 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HDGFL3Q9Y3E1 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HDGFL3Q9Y3E1 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
HDGFL3Q9Y3E1 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HDGFL3Q9Y3E1 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HDGFL3Q9Y3E1 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HDGFL3Q9Y3E1 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
HDGFL3Q9Y3E1 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
HDGFL3Q9Y3E1 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HDGFL3Q9Y3E1 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HDGFL3Q9Y3E1 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HDGFL3Q9Y3E1 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HDGFL3Q9Y3E1 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HDGFL3Q9Y3E1 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HDGFL3Q9Y3E1 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HDGFL3Q9Y3E1 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HDGFL3Q9Y3E1 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HDGFL3Q9Y3E1 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HDGFL3Q9Y3E1 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HDGFL3Q9Y3E1 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HDGFL3Q9Y3E1 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HDGFL3Q9Y3E1 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
HDGFL3Q9Y3E1 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HDGFL3Q9Y3E1 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HDGFL3Q9Y3E1 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
HDGFL3Q9Y3E1 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HDGFL3Q9Y3E1 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HDGFL3Q9Y3E1 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HDGFL3Q9Y3E1 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HDGFL3Q9Y3E1 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HDGFL3Q9Y3E1 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
HDGFL3Q9Y3E1 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
HDGFL3Q9Y3E1 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HDGFL3Q9Y3E1 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HDGFL3Q9Y3E1 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HDGFL3Q9Y3E1 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HDGFL3Q9Y3E1 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HDGFL3Q9Y3E1 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HDGFL3Q9Y3E1 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HDGFL3Q9Y3E1 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HDGFL3Q9Y3E1 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HDGFL3Q9Y3E1 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HDGFL3Q9Y3E1 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
HDGFL3Q9Y3E1 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HDGFL3Q9Y3E1 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HDGFL3Q9Y3E1 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HDGFL3Q9Y3E1 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HDGFL3Q9Y3E1 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HDGFL3Q9Y3E1 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HDGFL3Q9Y3E1 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HDGFL3Q9Y3E1 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HDGFL3Q9Y3E1 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HDGFL3Q9Y3E1 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HDGFL3Q9Y3E1 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HDGFL3Q9Y3E1 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HDGFL3Q9Y3E1 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HDGFL3Q9Y3E1 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HDGFL3Q9Y3E1 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HDGFL3Q9Y3E1 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HDGFL3Q9Y3E1 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HDGFL3Q9Y3E1 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HDGFL3Q9Y3E1 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms