Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A2

UTP11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP11Q9Y3A2 WNT5A-202ENST00000474267 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UTP11Q9Y3A2 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms