Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ4

APEX2, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX2Q9UBZ4 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APEX2Q9UBZ4 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APEX2Q9UBZ4 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APEX2Q9UBZ4 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APEX2Q9UBZ4 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APEX2Q9UBZ4 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APEX2Q9UBZ4 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APEX2Q9UBZ4 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APEX2Q9UBZ4 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APEX2Q9UBZ4 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APEX2Q9UBZ4 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APEX2Q9UBZ4 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APEX2Q9UBZ4 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APEX2Q9UBZ4 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APEX2Q9UBZ4 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
APEX2Q9UBZ4 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APEX2Q9UBZ4 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APEX2Q9UBZ4 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APEX2Q9UBZ4 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APEX2Q9UBZ4 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APEX2Q9UBZ4 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APEX2Q9UBZ4 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APEX2Q9UBZ4 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APEX2Q9UBZ4 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APEX2Q9UBZ4 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APEX2Q9UBZ4 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APEX2Q9UBZ4 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APEX2Q9UBZ4 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APEX2Q9UBZ4 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APEX2Q9UBZ4 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APEX2Q9UBZ4 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APEX2Q9UBZ4 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
APEX2Q9UBZ4 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APEX2Q9UBZ4 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APEX2Q9UBZ4 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APEX2Q9UBZ4 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APEX2Q9UBZ4 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APEX2Q9UBZ4 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APEX2Q9UBZ4 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APEX2Q9UBZ4 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APEX2Q9UBZ4 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APEX2Q9UBZ4 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APEX2Q9UBZ4 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APEX2Q9UBZ4 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APEX2Q9UBZ4 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APEX2Q9UBZ4 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APEX2Q9UBZ4 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APEX2Q9UBZ4 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APEX2Q9UBZ4 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APEX2Q9UBZ4 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APEX2Q9UBZ4 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APEX2Q9UBZ4 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APEX2Q9UBZ4 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APEX2Q9UBZ4 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APEX2Q9UBZ4 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APEX2Q9UBZ4 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APEX2Q9UBZ4 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APEX2Q9UBZ4 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APEX2Q9UBZ4 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APEX2Q9UBZ4 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APEX2Q9UBZ4 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APEX2Q9UBZ4 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APEX2Q9UBZ4 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APEX2Q9UBZ4 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APEX2Q9UBZ4 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APEX2Q9UBZ4 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APEX2Q9UBZ4 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APEX2Q9UBZ4 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APEX2Q9UBZ4 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APEX2Q9UBZ4 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APEX2Q9UBZ4 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APEX2Q9UBZ4 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APEX2Q9UBZ4 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APEX2Q9UBZ4 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
APEX2Q9UBZ4 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APEX2Q9UBZ4 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APEX2Q9UBZ4 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APEX2Q9UBZ4 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APEX2Q9UBZ4 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APEX2Q9UBZ4 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APEX2Q9UBZ4 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APEX2Q9UBZ4 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
APEX2Q9UBZ4 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APEX2Q9UBZ4 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APEX2Q9UBZ4 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APEX2Q9UBZ4 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APEX2Q9UBZ4 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APEX2Q9UBZ4 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APEX2Q9UBZ4 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APEX2Q9UBZ4 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
APEX2Q9UBZ4 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APEX2Q9UBZ4 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APEX2Q9UBZ4 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APEX2Q9UBZ4 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms