Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUP7

TRMT13, tRNA:m(4)X modification enzyme TRM13 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT13Q9NUP7 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TRMT13Q9NUP7 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRMT13Q9NUP7 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRMT13Q9NUP7 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRMT13Q9NUP7 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRMT13Q9NUP7 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRMT13Q9NUP7 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRMT13Q9NUP7 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRMT13Q9NUP7 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRMT13Q9NUP7 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRMT13Q9NUP7 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRMT13Q9NUP7 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRMT13Q9NUP7 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRMT13Q9NUP7 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRMT13Q9NUP7 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRMT13Q9NUP7 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRMT13Q9NUP7 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRMT13Q9NUP7 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRMT13Q9NUP7 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRMT13Q9NUP7 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRMT13Q9NUP7 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRMT13Q9NUP7 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRMT13Q9NUP7 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRMT13Q9NUP7 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRMT13Q9NUP7 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRMT13Q9NUP7 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRMT13Q9NUP7 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRMT13Q9NUP7 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRMT13Q9NUP7 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRMT13Q9NUP7 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRMT13Q9NUP7 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRMT13Q9NUP7 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRMT13Q9NUP7 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRMT13Q9NUP7 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRMT13Q9NUP7 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRMT13Q9NUP7 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRMT13Q9NUP7 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRMT13Q9NUP7 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRMT13Q9NUP7 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRMT13Q9NUP7 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRMT13Q9NUP7 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRMT13Q9NUP7 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRMT13Q9NUP7 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRMT13Q9NUP7 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRMT13Q9NUP7 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRMT13Q9NUP7 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRMT13Q9NUP7 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRMT13Q9NUP7 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRMT13Q9NUP7 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRMT13Q9NUP7 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRMT13Q9NUP7 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRMT13Q9NUP7 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRMT13Q9NUP7 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRMT13Q9NUP7 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRMT13Q9NUP7 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRMT13Q9NUP7 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRMT13Q9NUP7 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRMT13Q9NUP7 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRMT13Q9NUP7 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRMT13Q9NUP7 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRMT13Q9NUP7 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TRMT13Q9NUP7 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRMT13Q9NUP7 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRMT13Q9NUP7 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRMT13Q9NUP7 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRMT13Q9NUP7 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRMT13Q9NUP7 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRMT13Q9NUP7 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRMT13Q9NUP7 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRMT13Q9NUP7 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRMT13Q9NUP7 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRMT13Q9NUP7 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TRMT13Q9NUP7 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRMT13Q9NUP7 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRMT13Q9NUP7 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRMT13Q9NUP7 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRMT13Q9NUP7 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRMT13Q9NUP7 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRMT13Q9NUP7 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRMT13Q9NUP7 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRMT13Q9NUP7 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRMT13Q9NUP7 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRMT13Q9NUP7 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRMT13Q9NUP7 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRMT13Q9NUP7 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRMT13Q9NUP7 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRMT13Q9NUP7 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRMT13Q9NUP7 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRMT13Q9NUP7 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRMT13Q9NUP7 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRMT13Q9NUP7 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRMT13Q9NUP7 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRMT13Q9NUP7 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRMT13Q9NUP7 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRMT13Q9NUP7 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRMT13Q9NUP7 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRMT13Q9NUP7 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRMT13Q9NUP7 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRMT13Q9NUP7 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRMT13Q9NUP7 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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