Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 ABI2-201ENST00000261016 6634 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 ABI2-203ENST00000261018 6638 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 REXO1L1P-201ENST00000379010 6598 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 NPHP3-ACAD11-201ENST00000471702 7784 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms