Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQP4

PFDN4, Prefoldin subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN4Q9NQP4 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 RPS27L-201ENST00000330964 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 SFI1-229ENST00000540643 4226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 DLX3-201ENST00000434704 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 SLC9A3P3-201ENST00000457608 2229 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 NUMA1-233ENST00000616538 6998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 USP40-208ENST00000450966 5616 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 LINC00865-202ENST00000448963 4272 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 LDB3-202ENST00000361373 5297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 CNTLN-201ENST00000380641 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 OS9-201ENST00000257966 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 PREX1-201ENST00000371941 6636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 AL805961.2-201ENST00000642139 4817 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 PDE4DIP-227ENST00000529945 8824 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 CACNB4-210ENST00000539935 8378 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 GOPC-202ENST00000368498 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 RBL1-202ENST00000373664 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 TAB2-208ENST00000636456 3092 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79 ms