Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
POLR2J2Q9GZM3 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
POLR2J2Q9GZM3 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
POLR2J2Q9GZM3 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
POLR2J2Q9GZM3 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
POLR2J2Q9GZM3 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
POLR2J2Q9GZM3 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
POLR2J2Q9GZM3 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
POLR2J2Q9GZM3 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
POLR2J2Q9GZM3 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
POLR2J2Q9GZM3 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
POLR2J2Q9GZM3 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
POLR2J2Q9GZM3 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
POLR2J2Q9GZM3 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
POLR2J2Q9GZM3 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
POLR2J2Q9GZM3 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
POLR2J2Q9GZM3 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
POLR2J2Q9GZM3 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
POLR2J2Q9GZM3 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
POLR2J2Q9GZM3 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
POLR2J2Q9GZM3 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
POLR2J2Q9GZM3 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
POLR2J2Q9GZM3 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
POLR2J2Q9GZM3 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
POLR2J2Q9GZM3 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
POLR2J2Q9GZM3 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
POLR2J2Q9GZM3 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
POLR2J2Q9GZM3 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
POLR2J2Q9GZM3 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
POLR2J2Q9GZM3 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
POLR2J2Q9GZM3 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
POLR2J2Q9GZM3 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
POLR2J2Q9GZM3 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
POLR2J2Q9GZM3 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
POLR2J2Q9GZM3 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
POLR2J2Q9GZM3 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
POLR2J2Q9GZM3 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
POLR2J2Q9GZM3 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
POLR2J2Q9GZM3 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
POLR2J2Q9GZM3 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
POLR2J2Q9GZM3 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
POLR2J2Q9GZM3 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
POLR2J2Q9GZM3 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
POLR2J2Q9GZM3 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
POLR2J2Q9GZM3 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
POLR2J2Q9GZM3 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
POLR2J2Q9GZM3 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
POLR2J2Q9GZM3 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
POLR2J2Q9GZM3 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
POLR2J2Q9GZM3 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
POLR2J2Q9GZM3 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
POLR2J2Q9GZM3 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
POLR2J2Q9GZM3 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
POLR2J2Q9GZM3 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
POLR2J2Q9GZM3 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
POLR2J2Q9GZM3 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
POLR2J2Q9GZM3 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
POLR2J2Q9GZM3 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
POLR2J2Q9GZM3 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
POLR2J2Q9GZM3 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
POLR2J2Q9GZM3 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
POLR2J2Q9GZM3 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
POLR2J2Q9GZM3 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
POLR2J2Q9GZM3 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
POLR2J2Q9GZM3 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
POLR2J2Q9GZM3 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
POLR2J2Q9GZM3 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
POLR2J2Q9GZM3 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
POLR2J2Q9GZM3 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
POLR2J2Q9GZM3 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
POLR2J2Q9GZM3 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
POLR2J2Q9GZM3 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
POLR2J2Q9GZM3 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
POLR2J2Q9GZM3 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
POLR2J2Q9GZM3 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
POLR2J2Q9GZM3 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
POLR2J2Q9GZM3 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
POLR2J2Q9GZM3 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
POLR2J2Q9GZM3 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
POLR2J2Q9GZM3 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
POLR2J2Q9GZM3 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
POLR2J2Q9GZM3 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
POLR2J2Q9GZM3 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
POLR2J2Q9GZM3 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
POLR2J2Q9GZM3 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
POLR2J2Q9GZM3 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
POLR2J2Q9GZM3 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
POLR2J2Q9GZM3 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
POLR2J2Q9GZM3 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
POLR2J2Q9GZM3 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
POLR2J2Q9GZM3 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
POLR2J2Q9GZM3 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
POLR2J2Q9GZM3 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
POLR2J2Q9GZM3 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
POLR2J2Q9GZM3 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
POLR2J2Q9GZM3 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
POLR2J2Q9GZM3 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
POLR2J2Q9GZM3 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
POLR2J2Q9GZM3 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
POLR2J2Q9GZM3 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 149.7 ms