Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY11

PACSIN1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN1Q9BY11 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms