Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms