Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms