Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.8 ms