Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB2

HDAC11, Histone deacetylase 11, humanhuman

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11Q96DB2 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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HDAC11Q96DB2 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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HDAC11Q96DB2 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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HDAC11Q96DB2 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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HDAC11Q96DB2 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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HDAC11Q96DB2 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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HDAC11Q96DB2 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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HDAC11Q96DB2 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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HDAC11Q96DB2 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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HDAC11Q96DB2 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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HDAC11Q96DB2 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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HDAC11Q96DB2 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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HDAC11Q96DB2 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HDAC11Q96DB2 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HDAC11Q96DB2 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HDAC11Q96DB2 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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HDAC11Q96DB2 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HDAC11Q96DB2 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HDAC11Q96DB2 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HDAC11Q96DB2 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HDAC11Q96DB2 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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HDAC11Q96DB2 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HDAC11Q96DB2 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HDAC11Q96DB2 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HDAC11Q96DB2 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HDAC11Q96DB2 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HDAC11Q96DB2 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HDAC11Q96DB2 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HDAC11Q96DB2 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HDAC11Q96DB2 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HDAC11Q96DB2 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HDAC11Q96DB2 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HDAC11Q96DB2 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HDAC11Q96DB2 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HDAC11Q96DB2 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HDAC11Q96DB2 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HDAC11Q96DB2 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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