Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

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Length 71 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SPTSSAQ969W0 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SPTSSAQ969W0 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SPTSSAQ969W0 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SPTSSAQ969W0 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SPTSSAQ969W0 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SPTSSAQ969W0 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SPTSSAQ969W0 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
SPTSSAQ969W0 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SPTSSAQ969W0 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SPTSSAQ969W0 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SPTSSAQ969W0 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SPTSSAQ969W0 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SPTSSAQ969W0 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SPTSSAQ969W0 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SPTSSAQ969W0 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SPTSSAQ969W0 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SPTSSAQ969W0 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SPTSSAQ969W0 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SPTSSAQ969W0 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SPTSSAQ969W0 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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SPTSSAQ969W0 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
SPTSSAQ969W0 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
SPTSSAQ969W0 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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SPTSSAQ969W0 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SPTSSAQ969W0 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SPTSSAQ969W0 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SPTSSAQ969W0 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SPTSSAQ969W0 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SPTSSAQ969W0 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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SPTSSAQ969W0 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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SPTSSAQ969W0 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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SPTSSAQ969W0 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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SPTSSAQ969W0 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SPTSSAQ969W0 ZBTB11-201ENST00000312938 6020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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SPTSSAQ969W0 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SPTSSAQ969W0 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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SPTSSAQ969W0 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
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SPTSSAQ969W0 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SPTSSAQ969W0 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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SPTSSAQ969W0 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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SPTSSAQ969W0 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SPTSSAQ969W0 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SPTSSAQ969W0 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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SPTSSAQ969W0 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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SPTSSAQ969W0 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SPTSSAQ969W0 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SPTSSAQ969W0 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SPTSSAQ969W0 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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SPTSSAQ969W0 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SPTSSAQ969W0 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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SPTSSAQ969W0 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SPTSSAQ969W0 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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SPTSSAQ969W0 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SPTSSAQ969W0 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SPTSSAQ969W0 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SPTSSAQ969W0 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SPTSSAQ969W0 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SPTSSAQ969W0 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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