Protein–RNA interactions for Protein: Q969F9

HPS3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS3Q969F9 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms