Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDI0

CHD5, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 5, humanhuman

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Length 1,954 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD5Q8TDI0 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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