Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC112Q8NEF3 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC112Q8NEF3 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC112Q8NEF3 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC112Q8NEF3 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC112Q8NEF3 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC112Q8NEF3 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC112Q8NEF3 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC112Q8NEF3 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC112Q8NEF3 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC112Q8NEF3 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC112Q8NEF3 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC112Q8NEF3 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC112Q8NEF3 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC112Q8NEF3 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC112Q8NEF3 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC112Q8NEF3 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC112Q8NEF3 WDR66-201ENST00000288912 4467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC112Q8NEF3 C7orf57-202ENST00000420324 1957 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC112Q8NEF3 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC112Q8NEF3 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC112Q8NEF3 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC112Q8NEF3 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC112Q8NEF3 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC112Q8NEF3 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC112Q8NEF3 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC112Q8NEF3 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC112Q8NEF3 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC112Q8NEF3 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC112Q8NEF3 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC112Q8NEF3 TRPV1-206ENST00000571088 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC112Q8NEF3 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC112Q8NEF3 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC112Q8NEF3 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC112Q8NEF3 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC112Q8NEF3 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC112Q8NEF3 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC112Q8NEF3 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC112Q8NEF3 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC112Q8NEF3 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC112Q8NEF3 MANBA-202ENST00000505239 2577 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC112Q8NEF3 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC112Q8NEF3 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC112Q8NEF3 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC112Q8NEF3 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC112Q8NEF3 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC112Q8NEF3 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC112Q8NEF3 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC112Q8NEF3 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC112Q8NEF3 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC112Q8NEF3 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC112Q8NEF3 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC112Q8NEF3 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC112Q8NEF3 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC112Q8NEF3 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC112Q8NEF3 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC112Q8NEF3 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC112Q8NEF3 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC112Q8NEF3 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC112Q8NEF3 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC112Q8NEF3 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC112Q8NEF3 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC112Q8NEF3 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC112Q8NEF3 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC112Q8NEF3 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC112Q8NEF3 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC112Q8NEF3 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC112Q8NEF3 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC112Q8NEF3 MAMDC4-202ENST00000445819 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC112Q8NEF3 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC112Q8NEF3 KCNH6-204ENST00000581784 3017 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC112Q8NEF3 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC112Q8NEF3 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC112Q8NEF3 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC112Q8NEF3 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC112Q8NEF3 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC112Q8NEF3 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC112Q8NEF3 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC112Q8NEF3 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC112Q8NEF3 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC112Q8NEF3 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC112Q8NEF3 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC112Q8NEF3 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC112Q8NEF3 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC112Q8NEF3 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC112Q8NEF3 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC112Q8NEF3 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC112Q8NEF3 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC112Q8NEF3 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC112Q8NEF3 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC112Q8NEF3 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC112Q8NEF3 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC112Q8NEF3 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC112Q8NEF3 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC112Q8NEF3 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC112Q8NEF3 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC112Q8NEF3 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC112Q8NEF3 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC112Q8NEF3 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC112Q8NEF3 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.6 ms