Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC174Q6PII3 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC174Q6PII3 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC174Q6PII3 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC174Q6PII3 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC174Q6PII3 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC174Q6PII3 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC174Q6PII3 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC174Q6PII3 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC174Q6PII3 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC174Q6PII3 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC174Q6PII3 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC174Q6PII3 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC174Q6PII3 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC174Q6PII3 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC174Q6PII3 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC174Q6PII3 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC174Q6PII3 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC174Q6PII3 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC174Q6PII3 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC174Q6PII3 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC174Q6PII3 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC174Q6PII3 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC174Q6PII3 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC174Q6PII3 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC174Q6PII3 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC174Q6PII3 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC174Q6PII3 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC174Q6PII3 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC174Q6PII3 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC174Q6PII3 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC174Q6PII3 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC174Q6PII3 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC174Q6PII3 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC174Q6PII3 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC174Q6PII3 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC174Q6PII3 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC174Q6PII3 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC174Q6PII3 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC174Q6PII3 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC174Q6PII3 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC174Q6PII3 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC174Q6PII3 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC174Q6PII3 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC174Q6PII3 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC174Q6PII3 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC174Q6PII3 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC174Q6PII3 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC174Q6PII3 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC174Q6PII3 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC174Q6PII3 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC174Q6PII3 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC174Q6PII3 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC174Q6PII3 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC174Q6PII3 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms