Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2W1

PDZK1, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF3, humanhuman

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Length 519 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZK1Q5T2W1 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 CNTN2-201ENST00000331830 7999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 COL6A3-202ENST00000347401 8625 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 COL6A3-209ENST00000472056 8628 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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PDZK1Q5T2W1 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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PDZK1Q5T2W1 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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PDZK1Q5T2W1 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 ADCYAP1R1-207ENST00000614107 6575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 PI4KA-201ENST00000255882 6752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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PDZK1Q5T2W1 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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PDZK1Q5T2W1 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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PDZK1Q5T2W1 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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PDZK1Q5T2W1 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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PDZK1Q5T2W1 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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PDZK1Q5T2W1 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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PDZK1Q5T2W1 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 DSE-201ENST00000331677 7237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 MBTD1-204ENST00000586178 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 FUT8-203ENST00000360689 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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