Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 AC123912.6-201ENST00000612657 315 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 ERAS-202ENST00000636362 826 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 CACNA1A-211ENST00000592864 1623 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 RFX8-201ENST00000428343 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 FXYD2-202ENST00000292079 571 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 JPT2-203ENST00000382711 894 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 BX088651.3-201ENST00000418155 352 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 ZMIZ1-AS1-202ENST00000440151 814 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 TSTD1-206ENST00000466967 477 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 AC106789.1-201ENST00000512927 570 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 OR52V1P-201ENST00000515557 898 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 LINC01543-201ENST00000578367 900 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 CLUL1-202ENST00000400606 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 FGF21-202ENST00000593756 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 PDCD6-201ENST00000264933 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 MRPS28-201ENST00000276585 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 GAPDH-204ENST00000396859 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 SAPCD1-AS1-202ENST00000419679 461 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 CCND3P1-201ENST00000438347 580 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 IGKV1OR2-108-201ENST00000453673 353 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 AC022447.5-201ENST00000504817 392 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 AL139316.1-201ENST00000555643 568 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 RORA-AS1-202ENST00000558140 869 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 SHBG-217ENST00000576478 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 RN7SL605P-201ENST00000577229 281 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 RN7SL300P-201ENST00000582522 318 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 LINC01398-202ENST00000634819 1292 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 HNRNPC-205ENST00000553300 1375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 AK6-202ENST00000380822 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 PDE4DIP-202ENST00000369347 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 PCLAF-202ENST00000380258 911 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 AL355482.2-201ENST00000428646 1145 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 PEBP1P3-201ENST00000455475 548 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 C12orf73-204ENST00000546819 582 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 AC009120.2-205ENST00000561921 490 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 ANAPC11-214ENST00000578544 403 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 MECP2-213ENST00000622433 1071 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 NCS1-203ENST00000630865 1092 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 AL137077.2-201ENST00000635124 1608 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 OR4C14P-201ENST00000440929 923 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 AC233724.9-201ENST00000511694 407 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 AP003043.1-201ENST00000527804 547 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 AC024405.2-201ENST00000528459 810 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 AC005609.5-201ENST00000624712 1053 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 SFXN4-201ENST00000355697 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 NEK3-210ENST00000620675 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 PHKG1-201ENST00000297373 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 S100A2-202ENST00000368708 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 MPV17-209ENST00000405983 859 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 AC000077.1-201ENST00000420012 953 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.9 ms