Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 LARGE1-203ENST00000402320 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 AC002550.1-201ENST00000565916 1379 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 SYBU-222ENST00000529175 2717 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 STAT6-202ENST00000454075 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 PPT2-EGFL8-202ENST00000422437 4181 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 RGS8-201ENST00000258302 5606 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 AC125807.2-201ENST00000513358 3514 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 MALL-201ENST00000272462 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 SIGLEC10-206ENST00000441969 2768 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 LINC01024-201ENST00000499203 2769 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 DGKD-201ENST00000264057 6297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 IKBKE-201ENST00000578328 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 APOBR-201ENST00000431282 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 4625 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 AL450468.2-201ENST00000565955 1889 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 AL162431.2-201ENST00000358073 2424 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 TUBB8-204ENST00000564130 2438 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 LINC00434-201ENST00000423739 419 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 AL133325.2-201ENST00000431034 449 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 AC092941.2-201ENST00000444379 1008 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 MTND4LP12-201ENST00000448237 295 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 PRPSAP1-206ENST00000446526 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 ATXN7L3-202ENST00000454077 3523 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 RPGRIP1-202ENST00000400017 3940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 CWH43-204ENST00000513409 2390 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 AHI1-201ENST00000265602 4335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 ZMIZ2-215ENST00000615423 2772 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 PPARGC1B-202ENST00000360453 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 PARP10-205ENST00000525773 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 YY1AP1-208ENST00000361831 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 CHRNB1-202ENST00000536404 1623 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 EGLN3-205ENST00000547327 2849 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 RB1-201ENST00000267163 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 SLC7A7-201ENST00000285850 2263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 IGF2BP1-201ENST00000290341 8274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 VIT-201ENST00000379241 2525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 DCAF8-201ENST00000326837 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 FCGR3A-202ENST00000367969 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 AC084855.2-201ENST00000559400 2393 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 CST3-203ENST00000398411 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 TMEM200A-201ENST00000296978 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 AC092028.1-202ENST00000641483 3547 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 AC092028.1-201ENST00000641781 3540 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 AGAP3-226ENST00000622464 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 ABCB8-202ENST00000358849 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 174.9 ms