Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

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Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 SFMBT2-202ENST00000379711 692 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 TRBV7-3-201ENST00000390361 397 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 AC099567.1-201ENST00000414418 931 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 AC147651.3-201ENST00000429872 731 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 HORMAD2-AS1-202ENST00000432568 727 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 LINC01502-203ENST00000447907 880 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 B9D1-206ENST00000461069 923 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 VEGFA-219ENST00000518824 606 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 MYMX-201ENST00000573382 817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 AC016582.2-202ENST00000587765 1094 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 RNF34-211ENST00000613529 1449 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 WDR46-231ENST00000374617 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 PMF1-203ENST00000368279 1019 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 TSC22D3-202ENST00000372382 1216 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 AC015691.1-201ENST00000394793 535 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 KRT8P6-201ENST00000399259 1207 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 ABCD1P4-201ENST00000399687 604 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 TOMM5-203ENST00000401811 789 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 AP000640.1-201ENST00000525337 879 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 ZNF724-202ENST00000597037 780 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 RRAGA-201ENST00000380527 1589 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 METTL6-202ENST00000383790 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 SRP9-201ENST00000304786 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 KDF1-202ENST00000616918 1651 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 HTD2-205ENST00000477305 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 CAMP-201ENST00000296435 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 CIDEC-205ENST00000443115 443 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 PGAP2-207ENST00000463452 931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 C11orf58-207ENST00000525684 575 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 C11orf58-209ENST00000528634 776 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 SLC25A3-215ENST00000551265 580 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 KRT8P34-201ENST00000577607 1044 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 HKR1-220ENST00000591259 734 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 AC254633.1-201ENST00000606790 345 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 AC005865.2-202ENST00000635814 725 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 GPN3-203ENST00000543199 1604 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 CYB5R2-201ENST00000299498 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 RN7SL375P-201ENST00000492442 298 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 AC011676.2-201ENST00000518520 584 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 AC073569.2-201ENST00000551995 354 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 AL157871.1-201ENST00000555428 429 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 AL359219.1-201ENST00000556311 934 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 AC091304.3-201ENST00000566500 716 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
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