Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CYTH1Q15438 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms