Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms