Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 UBA52-214ENST00000599595 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 AC239600.1-201ENST00000603201 462 ntBASIC18■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 AP000356.3-203ENST00000614808 601 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 SESN3-201ENST00000278499 1710 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 MBIP-211ENST00000621657 1809 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 WDR46-231ENST00000374617 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 TFG-208ENST00000490574 1696 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 FGF21-202ENST00000593756 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 PCP2-201ENST00000311069 776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 DHRS7C-201ENST00000330255 1006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 HNRNPA1-201ENST00000330752 1294 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 CDRT15L2-201ENST00000399044 1048 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 AC073210.1-201ENST00000414799 232 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 DNM1P48-201ENST00000419538 439 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 AC103563.1-201ENST00000429316 123 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 TRAPPC4-202ENST00000434101 794 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 AL355500.1-201ENST00000439421 297 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 AL450346.2-201ENST00000495602 1024 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 TBC1D3P6-201ENST00000505954 962 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 CDK7-211ENST00000514676 1164 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 OR52V1P-201ENST00000515557 898 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 AP003031.2-205ENST00000531263 683 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 SMIM26-203ENST00000608034 670 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 TMEM56-RWDD3-202ENST00000604534 1491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 AKIP1-203ENST00000309377 1327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 CTSD-208ENST00000636843 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 CD3G-202ENST00000392883 1179 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 ABCD1P4-201ENST00000399687 604 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 AL121949.1-201ENST00000402043 968 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 U3.41-201ENST00000408711 219 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 AP001628.2-201ENST00000420273 784 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 CRIP1P2-201ENST00000425396 228 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 CA5BP1-205ENST00000435806 1064 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 AL356218.1-201ENST00000450864 353 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 PSME2P2-201ENST00000453033 700 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 AC009517.1-201ENST00000454750 570 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 AL445471.1-201ENST00000456316 820 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 MARK2P17-201ENST00000498560 841 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 AC004889.1-201ENST00000498693 856 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 AC087442.1-201ENST00000525563 249 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 LINC00643-202ENST00000553426 526 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 HMOX2-213ENST00000575120 1027 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
R3HDM1Q15032 RAPGEFL1-202ENST00000456989 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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