Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Length 741 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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