Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms