Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ATP1A4Q13733 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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ATP1A4Q13733 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
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ATP1A4Q13733 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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ATP1A4Q13733 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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ATP1A4Q13733 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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ATP1A4Q13733 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ATP1A4Q13733 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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