Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 ATF4-203ENST00000404241 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 FDFT1-214ENST00000528812 2013 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 AC022080.1-201ENST00000366255 781 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 PRAME-206ENST00000406503 740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 AC005154.1-232ENST00000582549 556 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 AL627230.2-201ENST00000613254 655 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 MIR6816-201ENST00000620368 66 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 SHANK2-202ENST00000357171 1373 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 CRYM-202ENST00000543948 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 HIST1H1D-201ENST00000244534 666 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 PGLYRP3-201ENST00000290722 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 AP002856.2-201ENST00000416553 584 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 AC006329.1-201ENST00000419422 705 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 LINC00483-202ENST00000419688 558 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 AC063952.3-201ENST00000467756 308 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 SNRPF-204ENST00000552085 815 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 AC006548.2-201ENST00000605217 529 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 HPX-213ENST00000615166 826 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 IQSEC2-207ENST00000638583 722 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 ATP5A1-201ENST00000282050 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 PSMC4-202ENST00000455878 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 SERPINA1-209ENST00000449399 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 HIST1H4B-201ENST00000377745 438 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 KLK11-203ENST00000391804 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 ZNF286A-201ENST00000395893 654 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 OST4-201ENST00000429985 559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 BPIFB5P-201ENST00000457066 1099 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 KLF3-AS1-203ENST00000504219 627 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 LINC02171-201ENST00000508619 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 AC087620.1-201ENST00000520037 447 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 KRT18P37-201ENST00000520711 1282 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 MYL6-218ENST00000550697 901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 LOXL1-AS1-207ENST00000565689 735 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 AC004528.1-201ENST00000588380 641 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
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