Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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