Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NEUROD1Q13562 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms