Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 CHD2-218ENST00000629346 1249 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
ATRQ13535 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
ATRQ13535 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
ATRQ13535 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ATRQ13535 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
ATRQ13535 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ATRQ13535 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ATRQ13535 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
ATRQ13535 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
ATRQ13535 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ATRQ13535 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ATRQ13535 AL008638.4-201ENST00000624792 1315 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
ATRQ13535 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ATRQ13535 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ATRQ13535 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ATRQ13535 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ATRQ13535 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
ATRQ13535 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ATRQ13535 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ATRQ13535 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
ATRQ13535 B3GNTL1-201ENST00000320865 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ATRQ13535 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ATRQ13535 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ATRQ13535 AC131011.1-201ENST00000366134 672 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
ATRQ13535 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC11.33□□□□□ -0.6
ATRQ13535 MIR1226-201ENST00000408658 75 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
ATRQ13535 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
ATRQ13535 HMGA1P2-201ENST00000430198 324 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
ATRQ13535 CR383656.13-201ENST00000550928 563 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
ATRQ13535 SLC25A3-215ENST00000551265 580 ntTSL 4 BASIC11.33□□□□□ -0.6
ATRQ13535 LINC01490-202ENST00000551399 1260 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ATRQ13535 AL512310.10-201ENST00000555580 563 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
ATRQ13535 AC007728.1-202ENST00000564510 787 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
ATRQ13535 YWHAE-212ENST00000575977 540 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
ATRQ13535 MIAT_exon5_3.1-201ENST00000613656 377 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
ATRQ13535 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ATRQ13535 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ATRQ13535 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ATRQ13535 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.33□□□□□ -0.6
ATRQ13535 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ATRQ13535 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
ATRQ13535 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
ATRQ13535 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ATRQ13535 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ATRQ13535 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
ATRQ13535 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
ATRQ13535 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
ATRQ13535 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
ATRQ13535 TGM1-202ENST00000544573 1581 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
ATRQ13535 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
ATRQ13535 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
ATRQ13535 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
ATRQ13535 HLA-DMB-258ENST00000418107 1397 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
ATRQ13535 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
ATRQ13535 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
ATRQ13535 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
ATRQ13535 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
ATRQ13535 MED11-201ENST00000293777 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
ATRQ13535 CD3G-202ENST00000392883 1179 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
ATRQ13535 PPM1N-203ENST00000396737 872 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
ATRQ13535 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
ATRQ13535 AC103563.2-201ENST00000442200 597 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
ATRQ13535 CRYBB2P1-204ENST00000509460 701 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
ATRQ13535 TPST2P1-201ENST00000564073 1102 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
ATRQ13535 AC005786.2-201ENST00000592368 369 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
ATRQ13535 RPL18A-203ENST00000599870 1084 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
ATRQ13535 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
ATRQ13535 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
ATRQ13535 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
ATRQ13535 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
ATRQ13535 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
ATRQ13535 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
ATRQ13535 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
ATRQ13535 FAM226B-201ENST00000602508 1490 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
ATRQ13535 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
ATRQ13535 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
ATRQ13535 DERL3-202ENST00000318109 860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
ATRQ13535 PITHD1-202ENST00000374524 1292 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
ATRQ13535 MIR611-201ENST00000384869 67 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
ATRQ13535 CDRT15L2-201ENST00000399044 1048 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
ATRQ13535 AL080243.1-201ENST00000423293 1060 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
ATRQ13535 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
ATRQ13535 LINC02507-201ENST00000509370 1028 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
ATRQ13535 SCGB1A1-202ENST00000534397 466 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
ATRQ13535 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
ATRQ13535 AL445363.2-201ENST00000554608 837 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
ATRQ13535 AC116025.1-201ENST00000575404 415 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
ATRQ13535 C17orf62-234ENST00000584503 584 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
ATRQ13535 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
ATRQ13535 UBA52-214ENST00000599595 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
ATRQ13535 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
ATRQ13535 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
ATRQ13535 AL445363.1-201ENST00000623749 952 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
ATRQ13535 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
ATRQ13535 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
ATRQ13535 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
ATRQ13535 AC117503.4-201ENST00000623229 1418 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
ATRQ13535 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
ATRQ13535 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
ATRQ13535 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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