Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 CDC45-205ENST00000437685 2072 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 NAA15-201ENST00000296543 6222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 CYB5D1-203ENST00000571846 1870 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 WDFY1-201ENST00000233055 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 DGKD-201ENST00000264057 6297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 STRCP1-201ENST00000509801 5328 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 KDELR1-201ENST00000330720 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.4 ms