Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
AP3B2Q13367 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.8 ms