Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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