Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
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PTPRJQ12913 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRJQ12913 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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PTPRJQ12913 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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PTPRJQ12913 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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PTPRJQ12913 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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PTPRJQ12913 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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PTPRJQ12913 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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PTPRJQ12913 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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PTPRJQ12913 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
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