Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

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Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
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FOXO1Q12778 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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