Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms