Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.1 ms