Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms