Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CRB1P82279 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CRB1P82279 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CRB1P82279 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CRB1P82279 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CRB1P82279 AC026470.1-201ENST00000478038 846 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CRB1P82279 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CRB1P82279 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CRB1P82279 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CRB1P82279 RPS5-204ENST00000598098 536 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CRB1P82279 AC006548.2-201ENST00000605217 529 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CRB1P82279 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CRB1P82279 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CRB1P82279 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CRB1P82279 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CRB1P82279 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CRB1P82279 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CRB1P82279 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CRB1P82279 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CRB1P82279 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CRB1P82279 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CRB1P82279 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CRB1P82279 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CRB1P82279 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CRB1P82279 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CRB1P82279 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CRB1P82279 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CRB1P82279 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CRB1P82279 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CRB1P82279 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CRB1P82279 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CRB1P82279 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CRB1P82279 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CRB1P82279 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CRB1P82279 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CRB1P82279 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CRB1P82279 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CRB1P82279 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CRB1P82279 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CRB1P82279 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CRB1P82279 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CRB1P82279 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CRB1P82279 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CRB1P82279 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CRB1P82279 OR2K2-201ENST00000302681 1078 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CRB1P82279 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CRB1P82279 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
CRB1P82279 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CRB1P82279 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CRB1P82279 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CRB1P82279 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CRB1P82279 AP005212.2-201ENST00000584979 510 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
CRB1P82279 LINC02018-201ENST00000608169 1268 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CRB1P82279 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CRB1P82279 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CRB1P82279 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CRB1P82279 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CRB1P82279 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CRB1P82279 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CRB1P82279 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CRB1P82279 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CRB1P82279 ZNF436-AS1-201ENST00000335648 2547 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CRB1P82279 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CRB1P82279 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CRB1P82279 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CRB1P82279 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CRB1P82279 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CRB1P82279 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CRB1P82279 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CRB1P82279 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CRB1P82279 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CRB1P82279 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CRB1P82279 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CRB1P82279 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CRB1P82279 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CRB1P82279 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CRB1P82279 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CRB1P82279 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CRB1P82279 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CRB1P82279 LINC01022-201ENST00000415652 394 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CRB1P82279 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CRB1P82279 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CRB1P82279 LINC01485-202ENST00000520324 566 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CRB1P82279 BANF1-205ENST00000527348 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CRB1P82279 AC105219.2-201ENST00000527908 299 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CRB1P82279 AC010186.1-201ENST00000546259 532 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CRB1P82279 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CRB1P82279 AC005154.1-232ENST00000582549 556 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CRB1P82279 BLACE-202ENST00000616210 540 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CRB1P82279 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CRB1P82279 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CRB1P82279 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CRB1P82279 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CRB1P82279 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CRB1P82279 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CRB1P82279 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CRB1P82279 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CRB1P82279 PSMC4-202ENST00000455878 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CRB1P82279 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CRB1P82279 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms