Protein–RNA interactions for Protein: P69849

NOMO3, Nodal modulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOMO3P69849 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NOMO3P69849 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NOMO3P69849 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NOMO3P69849 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NOMO3P69849 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NOMO3P69849 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NOMO3P69849 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NOMO3P69849 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NOMO3P69849 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NOMO3P69849 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NOMO3P69849 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NOMO3P69849 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NOMO3P69849 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NOMO3P69849 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NOMO3P69849 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NOMO3P69849 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NOMO3P69849 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NOMO3P69849 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NOMO3P69849 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NOMO3P69849 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NOMO3P69849 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NOMO3P69849 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NOMO3P69849 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NOMO3P69849 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NOMO3P69849 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NOMO3P69849 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NOMO3P69849 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NOMO3P69849 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NOMO3P69849 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NOMO3P69849 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NOMO3P69849 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NOMO3P69849 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NOMO3P69849 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NOMO3P69849 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NOMO3P69849 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NOMO3P69849 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NOMO3P69849 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NOMO3P69849 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NOMO3P69849 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NOMO3P69849 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NOMO3P69849 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NOMO3P69849 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NOMO3P69849 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NOMO3P69849 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NOMO3P69849 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NOMO3P69849 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NOMO3P69849 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NOMO3P69849 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NOMO3P69849 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NOMO3P69849 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NOMO3P69849 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NOMO3P69849 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NOMO3P69849 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NOMO3P69849 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NOMO3P69849 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NOMO3P69849 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NOMO3P69849 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NOMO3P69849 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NOMO3P69849 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NOMO3P69849 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NOMO3P69849 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NOMO3P69849 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NOMO3P69849 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NOMO3P69849 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NOMO3P69849 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NOMO3P69849 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NOMO3P69849 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NOMO3P69849 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NOMO3P69849 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NOMO3P69849 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NOMO3P69849 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NOMO3P69849 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NOMO3P69849 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NOMO3P69849 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NOMO3P69849 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NOMO3P69849 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NOMO3P69849 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NOMO3P69849 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NOMO3P69849 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NOMO3P69849 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NOMO3P69849 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NOMO3P69849 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NOMO3P69849 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NOMO3P69849 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NOMO3P69849 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NOMO3P69849 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NOMO3P69849 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NOMO3P69849 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NOMO3P69849 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NOMO3P69849 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NOMO3P69849 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NOMO3P69849 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NOMO3P69849 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NOMO3P69849 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NOMO3P69849 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NOMO3P69849 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NOMO3P69849 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NOMO3P69849 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NOMO3P69849 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NOMO3P69849 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms